Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 ENA2YDR039C 3276 nt3.94□□□□□ -1.78
CSE4P36012 ENA1YDR040C 3276 nt3.94□□□□□ -1.78
CSE4P36012 PEX1YKL197C 3132 nt3.93□□□□□ -1.78
CSE4P36012 MDM20YOL076W 2391 nt3.93□□□□□ -1.78
CSE4P36012 CHO2YGR157W 2610 nt3.93□□□□□ -1.78
CSE4P36012 YGL069CYGL069C 465 nt3.92□□□□□ -1.78
CSE4P36012 UPS1YLR193C 528 nt3.92□□□□□ -1.78
CSE4P36012 POM152YMR129W 4014 nt3.92□□□□□ -1.78
CSE4P36012 ROG1YGL144C 2058 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 DOT6YER088C 2013 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 YGR164WYGR164W 336 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 DFG16YOR030W 1860 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 YJL070CYJL070C 2667 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 SNU114YKL173W 3027 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 SIZ1YDR409W 2715 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 MDV1YJL112W 2145 nt3.91□□□□□ -1.78
CSE4P36012 ITC1YGL133W 3795 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 BCH1YMR237W 2175 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 PSK2YOL045W 3306 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 SYT1YPR095C 3681 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 DUF1YOL087C 3351 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 SOK1YDR006C 2706 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 IPT1YDR072C 1584 nt3.9□□□□□ -1.78
CSE4P36012 YML007C-AYML007C-A 111 nt3.9□□□□□ -1.79
CSE4P36012 snR48snR48 113 nt3.9□□□□□ -1.79
CSE4P36012 NPR3YHL023C 3441 nt3.9□□□□□ -1.79
CSE4P36012 NUP120YKL057C 3114 nt3.9□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YER189WYER189W 369 nt3.89□□□□□ -1.79
CSE4P36012 GEP4YHR100C 558 nt3.89□□□□□ -1.79
CSE4P36012 RRT15YLR162W-A 189 nt3.89□□□□□ -1.79
CSE4P36012 RTC6YPL183W-A 282 nt3.89□□□□□ -1.79
CSE4P36012 RLI1YDR091C 1827 nt3.88□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YBL083CYBL083C 426 nt3.88□□□□□ -1.79
CSE4P36012 LCD1YDR499W 2244 nt3.88□□□□□ -1.79
CSE4P36012 PHO2YDL106C 1680 nt3.87□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YDR426CYDR426C 378 nt3.87□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YLR255CYLR255C 354 nt3.87□□□□□ -1.79
CSE4P36012 ECM21YBL101C 3354 nt3.87□□□□□ -1.79
CSE4P36012 PUF4YGL014W 2667 nt3.87□□□□□ -1.79
CSE4P36012 RAD5YLR032W 3510 nt3.86□□□□□ -1.79
CSE4P36012 MRP10YDL045W-A 288 nt3.86□□□□□ -1.79
CSE4P36012 GUP1YGL084C 1683 nt3.86□□□□□ -1.79
CSE4P36012 ORC1YML065W 2745 nt3.86□□□□□ -1.79
CSE4P36012 HEH2YDR458C 1992 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 PRE4YFR050C 801 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 TRX1YLR043C 312 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 FPR1YNL135C 345 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 TRM2YKR056W 1920 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 GCN1YGL195W 8019 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 HOS3YPL116W 2094 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YOL057WYOL057W 2136 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 RSE1YML049C 4086 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 PDE2YOR360C 1581 nt3.85□□□□□ -1.79
CSE4P36012 PAN3YKL025C 2040 nt3.84□□□□□ -1.79
CSE4P36012 NUT2YPR168W 474 nt3.84□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.84□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YBR224WYBR224W 516 nt3.84□□□□□ -1.79
CSE4P36012 SET1YHR119W 3243 nt3.84□□□□□ -1.79
CSE4P36012 YAT2YER024W 2772 nt3.84□□□□□ -1.8
CSE4P36012 ALK2YBL009W 2031 nt3.83□□□□□ -1.8
CSE4P36012 MDM1YML104C 3384 nt3.83□□□□□ -1.8
CSE4P36012 TOF2YKR010C 2316 nt3.83□□□□□ -1.8
CSE4P36012 MPH1YIR002C 2982 nt3.83□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.83□□□□□ -1.8
CSE4P36012 LSM7YNL147W 348 nt3.83□□□□□ -1.8
CSE4P36012 SGD1YLR336C 2700 nt3.83□□□□□ -1.8
CSE4P36012 SAK1YER129W 3429 nt3.82□□□□□ -1.8
CSE4P36012 ZDS2YML109W 2829 nt3.82□□□□□ -1.8
CSE4P36012 XRS2YDR369C 2565 nt3.82□□□□□ -1.8
CSE4P36012 COF1YLL050C 432 nt3.82□□□□□ -1.8
CSE4P36012 PFK26YIL107C 2484 nt3.82□□□□□ -1.8
CSE4P36012 MET5YJR137C 4329 nt3.81□□□□□ -1.8
CSE4P36012 CDC27YBL084C 2277 nt3.81□□□□□ -1.8
CSE4P36012 SSS1YDR086C 243 nt3.81□□□□□ -1.8
CSE4P36012 SMD1YGR074W 441 nt3.81□□□□□ -1.8
CSE4P36012 GRX8YLR364W 330 nt3.81□□□□□ -1.8
CSE4P36012 NMD2YHR077C 3270 nt3.81□□□□□ -1.8
CSE4P36012 BAS1YKR099W 2436 nt3.81□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.8□□□□□ -1.8
CSE4P36012 ERP6YGL002W 651 nt3.8□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt3.8□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YOR333CYOR333C 417 nt3.8□□□□□ -1.8
CSE4P36012 SPT4YGR063C 309 nt3.79□□□□□ -1.8
CSE4P36012 INA22YIR024C 651 nt3.79□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt3.79□□□□□ -1.8
CSE4P36012 BMS1YPL217C 3552 nt3.79□□□□□ -1.8
CSE4P36012 NAB3YPL190C 2409 nt3.79□□□□□ -1.8
CSE4P36012 KAP95YLR347C 2586 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YGL217CYGL217C 342 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YML037CYML037C 1023 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YOR376WYOR376W 369 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 SPO14YKR031C 5052 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 NAB6YML117W 3405 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 BUB1YGR188C 3066 nt3.78□□□□□ -1.8
CSE4P36012 TMN3YER113C 2121 nt3.77□□□□□ -1.81
CSE4P36012 RIX1YHR197W 2292 nt3.77□□□□□ -1.81
CSE4P36012 HSC82YMR186W 2118 nt3.76□□□□□ -1.81
CSE4P36012 SIN3YOL004W 4611 nt3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.7 ms