Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RYKP34925 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RYKP34925 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RYKP34925 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RYKP34925 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RYKP34925 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RYKP34925 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RYKP34925 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RYKP34925 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RYKP34925 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RYKP34925 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RYKP34925 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RYKP34925 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms