Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCD1P33897 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD1P33897 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms