Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC13P31276 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC13P31276 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms