Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP1P30622 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP1P30622 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms