Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCKSP29966 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCKSP29966 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms