Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA2P25787 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA2P25787 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA2P25787 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA2P25787 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA2P25787 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA2P25787 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA2P25787 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA2P25787 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMA2P25787 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA2P25787 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMA2P25787 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms