Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EFNA1P20827 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms