Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB9P17482 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms