Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDGFRAP16234 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRAP16234 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRAP16234 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRAP16234 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRAP16234 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDGFRAP16234 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDGFRAP16234 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDGFRAP16234 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRAP16234 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRAP16234 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms