Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIP12755 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIP12755 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKIP12755 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKIP12755 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKIP12755 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKIP12755 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKIP12755 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIP12755 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIP12755 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIP12755 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIP12755 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIP12755 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SKIP12755 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms