Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C9P11712 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C9P11712 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms