Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD28P10747 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CD28P10747 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD28P10747 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD28P10747 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD28P10747 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD28P10747 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms