Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms