Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3P09919 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3P09919 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3P09919 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3P09919 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3P09919 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms