Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIL1P09327 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIL1P09327 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIL1P09327 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIL1P09327 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIL1P09327 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIL1P09327 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIL1P09327 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIL1P09327 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms