Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRCP08575 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRCP08575 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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