Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUDT3O95989 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUDT3O95989 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms