Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR1AO95602 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR1AO95602 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms