Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG7O95352 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG7O95352 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG7O95352 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG7O95352 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG7O95352 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG7O95352 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG7O95352 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG7O95352 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG7O95352 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms