Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRMUO75648 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRMUO75648 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRMUO75648 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRMUO75648 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms