Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SKAP2O75563 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms