Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSDE1O75534 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSDE1O75534 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms