Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR5O75473 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR5O75473 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR5O75473 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR5O75473 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR5O75473 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR5O75473 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR5O75473 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR5O75473 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR5O75473 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR5O75473 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms