Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN3BO60391 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms