Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX15O60248 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX15O60248 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOX15O60248 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOX15O60248 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms