Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EDIL3O43854 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms