Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP2AO43633 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP2AO43633 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms