Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SIAH2O43255 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms