Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARPC1BO15143 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms