Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PODXLO00592 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PODXLO00592 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PODXLO00592 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PODXLO00592 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PODXLO00592 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms