Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLIM4O00461 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms