Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP23O00161 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNAP23O00161 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms