Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H7C1W4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H7C1W4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H7C1W4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H7C1W4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H7C1W4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H7C1W4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H7C1W4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms