Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L11C9JVI0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP17L11C9JVI0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms