Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms