Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOBPA7XYQ1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOBPA7XYQ1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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