Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC69A6NI79 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms