Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM3A6NDB9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms