Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PQD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PQD8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms