Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINOS1-NBL1R4GNA1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINOS1-NBL1R4GNA1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINOS1-NBL1R4GNA1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINOS1-NBL1R4GNA1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINOS1-NBL1R4GNA1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms