Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00312Q9Y6C7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms