Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AUP1Q9Y679 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AUP1Q9Y679 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms