Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I2

PCDHA10, Protocadherin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA10Q9Y5I2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA10Q9Y5I2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA10Q9Y5I2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms