Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP12Q9Y561 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms