Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UTP11Q9Y3A2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms