Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF13Q9Y2Y9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms