Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC3Q9UQE7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms