Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS5Q9UPZ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS5Q9UPZ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms