Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ALKQ9UM73 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ALKQ9UM73 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms